Para llevar a cabo su finalidad fundamental -la de contribuir al mejor conocimiento científico de los procesos contemporáneos de integración y unificación de Europa, favoreciendo la interdisciplinariedad-, el IEE cuenta con un nómina sobresaliente de investigadores (que aparecen reseñados por orden alfabético en la su página web), que conforman unas líneas de investigación sobresalientes de su responsabilidad (reseñadas en la web), como se demuestra por la tarea realizad, ya de manera individual, ya como IP, o I, de equipos competitivos de investigación. Al mismo tiempo, dichos investigadores forman parte de grupos de investigación, ya se trate de GIR o de Unidades de Investigación Consolidada, que llevan a cabo su tarea investigadora en los campos de interés científico del IEE, destacando en las siguientes parcelas: «Garantías Procesales y Unión Europea», «Derecho Concursal y Derecho de la Competencia», «Derecho de Familia y Derechos Humanos», «Derechos de la Economía y de la Empresa», y «Derecho de las Nuevas Tecnologías y Delincuencia Informática».